Najważniejszymi walorami środowiska naturalnego Szczecina są rzeźba terenu (od depresyjnych obszarów 0,1 m p.p.m. do 147 m n.p.m w Górach Bukowych), urozmaicona sieć wodną, łagodne warunki klimatyczne, duża ilość zieleni i bogata fauna (niemalże w centrum miasta można zobaczyć żyjące na Międzyodrzu orły bieliki).

Zieleń jest wizytówką Szczecina. Na terenie miast jest 16 parków o łącznej powierzchni ponad 161 ha. Rośnie w nich wiele unikalnych gatunków roślin. W największym z nich Parku Kasprowicza (27 ha) rośnie około 230 gatunków drzew i krzewów. Jednak największym w mieście skupiskiem zieleni jest Cmentarz Centralny, który pełni także rolę parku. Na 168 ha rośnie aż 360 gatunków drzew i krzewów. Lasy miejskie zajmują powierzchnię ponad 2,4 tys. ha. Szczecin sąsiaduje z trzema puszczami: Wkrzańską, Bukową i Goleniowską. Takie położenie to unikat w skali kraju i Europy i jest bezsprzecznym atutem miasta. O charakterze przyrodniczym miasta w dużym stopniu decyduje woda: Odra ze swoimi odnogami, mniejsze rzeki i potoki, zbiorniki wody stojącej (Jezioro Głębokie, Szmaragdowe, Słoneczne, Rusałka). W obrębie Szczecina znajduje się czwarte pod względem wielkości jezioro w Polsce – Jezioro Dąbie. Na zieleń i wodę stawia miasto w marce „Floating Garden”.